首个桃完整泛变异组图谱发布
2025-05-08 11:04:00
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新京报讯 据中国农业科学院网站消息，日前，中国农业科学院郑州果树研究所桃资源与育种创新团队发表了首个桃完整泛变异组图谱，研究发现了70.6%的新变异和3289个新基因，揭示了全球桃的亲缘关系和进化路线，开发了基因发掘新策略，实现了基因及功能变异的“一步定位”。相关研究发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
该研究利用1020份桃种质基因组数据，检测了结构变异等目前已知的所有变异类型，构建了首个完整变异组图谱，包含70.6%的新变异；构建了泛基因组图谱，鉴定了3289个新基因，发现桃驯化和进化过程中基因数目显著增加；解析了全球桃基因渐渗关系，重构了全球桃传播进化路线，发现扁桃参与了山桃的形成，栽培桃最可能的直接野生祖先是光核桃，甘肃桃参与了新疆桃的形成。研究还提出了基因定位新策略GWASPV，在40个农艺性状、51个环境性状和1857个代谢物性状的基因定位中应用，新发现了2000多个关联变异，实现了很多性状关键基因和功能变异的一步鉴定，显著提高了基因定位和基因发掘效率，为桃分子育种提供了理论依据和基因资源。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然基金、中国农业科学院青创专项等项目的资助。
编辑 张树婧